Vor der Laser–Operation werden in das Auge bzw. in die Augen örtliche Betäubungstropfen getropft. Ist der Patient sehr nervös oder hat sogar Angst, so wird ihm zusätzlich ein Beruhigungsmedikament gegeben.

Wie bei dem LASIK–Verfahren wird zunächst die obere Schicht der Hornhaut abgetrennt und wie ein Deckel zurückgeklappt ( Flap ). Allerdings wird hier zur Abtrennung kein hobelartiges Schneidewerkzeug ( Mikrokeratom ) verwendet sondern ein Femtosekunden – Laser. Hierzu werden ein Kontaktglas und ein Fixationsring auf das Auge gesetzt.

Der zu benutzende Femto–Laser ist an einem Computer angeschlossen, welcher die genauen Werte für die Lage, die Dicke, die Größe und die Wirktiefe der Hornhautschicht ausrechnet und anwendet. Nun erzeugt der Laser in der eingegebenen Tiefe durch Laserstrahlen etliche tausend winzige Dampfblasen. Dabei dauert ein Laserimpuls nur 100 Milliardstel Sekunde.

Ist dies geschehen, so kann der Fixationsring beseitigt werden und mit einem geeigneten Instrument den Flap zurückgeklappt werden.  Anders als bei der LASIK–Behandlung ist der Flap noch dünner.

Anschließend wird ein weiterer spezieller Laser ( Excimer – Laser ) eingesetzt. Dieser Laser trägt eine bestimmte Schichtdicke der Hornhaut, welche zuvor in einer Untersuchung genauestens berechnet wurde, abgetragen. Dies ist von der Fehlsichtigkeit abhängig.

Leidet der Patient sowohl an einer Hornhautverkrümmung als auch an einer Kurzsichtigkeit oder Weitsichtigkeit, so können beide Sehfehler auf einmal korrigiert werden.

Wurde der Lasereingriff beendet, wird der Flap schließlich wieder in seine Ausgangsposition geklappt. Dieser haftet von ganz alleine, deswegen muss lediglich noch ein Augenverband angelegt werden.